ayuda con DD

bueno mi problema es el siguiente , lo que pasa es que tengo un disco fujitsu de 40gb instalado en una computadora como maestro , por que en esa computadora tengo tres discos duros todo funcionaba muy bien solo que derepente prendi la computadora y le puse iniciar desde este disco duro y me salio un mensaje que dice que no puedo iniciar windows por que faltan unos archivos de la carpeta C: windows/system32 y que necesito el disco de intalacion para reintalar los archivos , entonces inicio con el disco de windows xp y le puse reintalar los archivos pero me sale que no se puede por que el disco duro esta dañado o tiene formato desconocido , entonces decidi intentar de nuevo iniciar con este disco en otra computadora pero ahora cuando lo instalo me sale que la bios lo reconoce pero de diferente capacidad y con un nombre raro .... un amigo me habia dicho que al parecer era un virus en el el sector de arranque , pero queria saber que opinan ustedes? ............saludos a todos!!!!!!